mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTACATGTTAGCATTAACA TTAATGCTAATTGTGATAGGGGT CTATATGCTGTTAATGCTAATTGTGATAGGGGTTTTTACCTCCGTCTGACTCCTACATGTTAGCATTAACAGGGTATGATG 0 2 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-155 3e-19 cfa-mir-155 5e-24 -34.1 .(((((.((((((((((((((.(((.((((((((...((....))..))))))))))))))))))))))))).)))))... (-34.10)