mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGACGAACAAAAGGTTTGT AAGCTTTTTGCTCGCGTTATGT CTCTCAGGGAAGCTTTTTGCTCGCGTTATGTTTCTCATCCGAATATAAGACGAACAAAAGGTTTGTCTGAGGGCAGAGTG 4 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-208 2e-29 eca-mir-208b 9e-38 -30.7 ((((((((.((((((((((.(((..((((((((.......))))))))..))).)))))))))).))))))))....... (-30.70)