mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAGCAGGCACAGACAGGCAG GCCTGTCTACACTTGCTGTGC GGCCTGGCTGGACGGAGTTGTCATGTGTCTGCCTGTCTACACTTGCTGTGCAGAACATCCGCTCACCTGTACAGCAGGCACAGACAGGCAGTCACATGACAACCCAGCCT 3 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-214 4e-50 cfa-mir-214 6e-58 -67.62 .....((((((.....(((((((((((.((((((((((...((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).))))))))))))))))). (-67.62)