mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACCTCCTCTCTCCTCAGGT CCTTGGTGAGGACTCGGGAGGTGGA CCTACCCTTGGTGAGGACTCGGGAGGTGGAGGGTGGCGCTGCCAGAGCCAGGGCACTGTCTCAGCTCGCTTCTCCCCCCACCTCCTCTCTCCTCAGGTGCGGTTGCAG 3 5 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-1224 7e-24 bta-mir-1224 3e-41 -51 ((((((.....((((((...(((((((((.(((.((((..((..(((.(((....))).))).)).))))...))).)))))))))...)))))))))).))...... (-51.00)