mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGCTATGTGCCAGGCA CTTGGCACCTAGTAAGCACT TAGATCAGTGCTTGGCACCTAGTAAGCACTCAGTATATACTTGTTGAGTGCCTGCTATGTGCCAGGCATTGTGCTGAG 2 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-598 0.00006 bta-mir-1271 5e-36 -42.9 (((..(((((((((((((.(((((.((((((((((......)))))))))).))))).)))))))))))))..))).. (-42.90)