mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGTGGGGTTTTGACCCTAACC TTAGGGCCCTGGCTCCATCTCC CCTAACTGGGTTAGGGCCCTGGCTCCATCTCCTTTAGGAAAACCTTCTGTGGGGAGTGGGGTTTTGACCCTAACCCAGCTGGGCT 5 0 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-1296 2e-39 bta-mir-1296 2e-38 -47 ((((.(((((((((((.(..((((((((..(((.(((((.....))))).)))..))))))))..).))))))))))).)))).. (-47.00)