mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGTTGGCTCTGGTGGTGATG CACCACCTCCCCTGCAAACGTCC GTCTCCACCACCTCCCCTGCAAACGTCCAGTGATGCAGAGGTAATGGACGTTGGCTCTGGTGGTGATGGACAGGCCGAAC 6 3 3' arm Sus_scrofa mirbase mir-1306 2e-32 ssc-mir-1306 4e-40 -31.6 ((((.(((((((......((.((((((((....(((....))).)))))))).))...)))))))..))))......... (-31.60)