mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACCTGCATGTTAGTCTTTGGTTCT GACTCGACTGGTGTGCGGACACTT TGAGATAAATATACCTGCATGTTAGTCTTTGGTTCTGGTAGAAATGACATGCAATTGTGCTGCCATATTTTACTATCAGGACTCGACTGGTGTGCGGACACTTTGGTTAGTAA 7 2 5' arm Sus_scrofa mirbase SNORA53 4e-41 100 -33.8 ..............(((((..((((((...((((((((((((((((.((.(((....))))).)))...)).))))))))))).))))))..)))))..(((......))).. (-33.80)