mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTATACAGTCTATTGCCTTCCT GTACGTGTTTTTGGTGTCTGGACAAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGTGGGAGGGATCAAACCCTGTTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTGTGTCACCTAAGGTCTGC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 7e-43 dre-let-7a-6 8e-27 -47.4 ...((..((((.((((.(...((((((.((((((((((..(((((((((...((((((((......)))).))))......)))))))))..))))))))))))))))).)))).))))..)). (-47.40)