mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTATACAGTCTATTGCCTTCCC CACAGTGAACCTGTGTGTTTCTTCAAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGTGGGAAGGATCACATCCTATTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCCTGAGAGACACAATGACCACGAGTG 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 3e-42 dre-let-7a-5 8e-27 -54.2 (((.(((......((((((((((..(((..(((((((((..((((((((((.((((.(((((...))))).)))).)....)))))))))..)))))))))..))))))))))))).....)))..))) (-54.20)