mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTGTGGTT CTATACAACCTACTGCCTTCCC TCGGACAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTGTGGTTTCAGGGTTGTGTTTTTGCCCCATCAGGAGTTAACTATACAACCTACTGCCTTCCCTGAAGGG 1 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 3e-32 fru-let-7b 1e-37 -45.4 .....(((((.(((((((((((((((((((((((.((((.........))))......))...))))))))))))))))))))))))))..... (-45.40)