mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC GTGTGCATCCAGGCTGAGGTAGTAGGTTGTATGGTTTCGAATGACACCATGGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCTTGGAGTACAC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 1e-25 xtr-let-7c 4e-37 -41.5 ((((((.((((((..(((.(((.(((((((((((((((..(((....)))..))...))))))))))))).))).)))..)))))))))))) (-41.50)