mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC TGTGCGTTGCGGTGTGAGGTAGTTGGTTGTATGGTTTTGCATAATAAACAGCCCGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCCTGCGGCTGCACG 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 3e-26 fru-let-7d 3e-32 -37.43 .(((((((((((.(.(((.(((..((((((((((((..((.................)).))))))))))))..))).))).).))))))).)))). (-37.43)