mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTGGTTGTATGGTT CTGTACAACCTTCTAGCTTTCC CGCTGCAGGCTGAGGTAGTTGGTTGTATGGTTTTGCATCATAATCAGCCTGGAGTTAACTGTACAACCTTCTAGCTTTCCCTGCGGTG 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 4e-28 dre-let-7d-1 1e-30 -39.1 (((((((((..(((.(((..((((((((((((..((..((.........))..)).))))))))))))..))).)))..))))))))) (-39.10)