mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGATTGAATAGTT CTATACAATCTACTGTCTTTCC GCTGTTCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGAGCCCTGCGCTCTCTCTCTGAGATAACTATACAATCTACTGTCTTTCCTAAGGCGACAGC 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 1e-40 dre-let-7e-2 5e-52 -43.1 (((((((((((((..(((..(((((((((.(((((((((((((.....))))).........)))))))).)))))))))..))))))))))..)))))) (-43.10)