mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAAGTTGTGTTGTT CTATACAATTTACTGCCTTCCA GAGTTGGCTGTGTTGTGGTGAGGTAGTAAGTTGTGTTGTTGTTGGGGATCAGTATAGTATGGCCCTTGAAGGAGATAACTATACAATTTACTGCCTTCCATAATGCAGACTCTC 2 0 5' arm Danio_rerio mirbase let-7 3e-45 tni-let-7h 2e-18 -51.31 ((((...(((((((((((.(((((((((((((((((.((((((((((.(((........))))))).......)))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).. (-51.31)