mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATGTGCCCATA GCCTACTTGGTGTACATACTTCTTTATGTGCCCATATGAACATATAAAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTCTTGGTCAGGT 1 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-1 6e-24 tni-mir-1 5e-27 -32.96 (((((((.((.((((((((((((((((((..(((((...............))))).)))))))))))))))))).)).))).)))) (-32.96)