mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAACCGCAGTCGTCCTCT TGTGTGTGTGTTCTGCCCTCTGCGGAGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTGAAAATGAACAAAAACCAACAACAAACCGCAGTCGTCCTCTCAGCACGGGGCCCACACCTGCAGAGCACA 3 2 5' arm Danio_rerio mirbase mir-7 1e-44 csa-mir-7 0.000001 -45.57 ......(((((((((((((((((.(((.(((.((((.(((..((((((((..................)))))))).))))))).))).))).))).)))).........)))))))))) (-45.57)