mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGGGTTGGCTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTTATTCATTCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAACAAGAATCCC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 0.00000000000002 fru-mir-9-1 5e-30 -39.2 ((((((...(((((..(((((((((((((((.((((((((.....)))...))))).)))))))))))))))..)))))..)))))) (-39.20)