mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GCTCTCCTCTGGTGACTTTTGCACTTGGAGGCGTGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTGCTGGCCGTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAGAGCCGCTTCTATCAGCAACGTATGGAGCATTGC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 1e-19 fru-mir-9-2 1e-25 -57.8 (((((.....(....)..((((...((((((((.(((.(((..(((((((((((((((.(((((.((.(....)))))))).)))))))))))))))..))).)))))))))))...)))).....)))))..... (-57.80)