mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGT TCAGGGGGTTGGTTTCTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTTATAACACTGTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAGAAATAATTCCCAAAATCTTTGG 1 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 0.000000000001 dre-mir-9-7 4e-19 -40.1 ...((((((((.(((((((.(((((((((((((((.(((((((......))..))))).))))))))))))))))).)))))))))))))........... (-40.10)