mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGAGAACCGAATGTA TGGGTTAGTTTTTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTTTATGTGATATCATAAAGCTAGAGAACCGAATGTATAAACTAATTCCA 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 1e-21 fru-mir-9-4 2e-38 -30.9 .((((((((((.....(((((((.(((((((.((((((((.....))).))))).))))))).))))))).....)))))))))).. (-30.90)