mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGAAGCGAGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTATTTTGCACTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAAAACTGCCTCC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 2e-17 gga-mir-9-2 1e-33 -37.7 (((.((.((((.(((..(((((((((((((((.(((((((.......)).))))).)))))))))))))))..))).)))))).))) (-37.70)