mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGAGGTAGTTGCTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTTTATCTGCCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAGAAACGTCCTCC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 0.0000000000003 xtr-mir-9-3 8e-20 -43.8 (((((..(((.(((..(((((((((((((((.((((((.((......)).)))))).)))))))))))))))..))).)))..))))) (-43.80)