mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGAGAACCGAAAGT GGGTTAGTTTTTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTTATGAAATATCATAAAGCTAGAGAACCGAAAGTAGAAACTATACCT 2 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-9 2e-26 dre-mir-9-4 8e-26 -32.7 ((((((((((((((.(((((((.(((((((.(((((...........))))).))))))).))))))))).)))))))).)))) (-32.70)