mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACAGAATGGTTTGTG CAGGCCGTACTGTGCTGCGGCA CCTGTCGGTACTGTAGCAGCACAGAATGGTTTGTGAGTTATAACGGGGGTGCAGGCCGTACTGTGCTGCGGCAACAACGACAGG 2 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-15 3e-41 tni-mir-15a 0.00000006 -43.4 (((((((....(((.(((((((((.((((((((((..((......))..)))))))))).))))))))).)))....))))))) (-43.40)