mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACATCATGGTTTGTA CGAATCATGATGTGCTGTCACT GTCTGTCGTCATCTTTTTATTTAGCCCTGAGTGCCCTGTAGCAGCACATCATGGTTTGTAAGTTATAAGGGCAAATTCCGAATCATGATGTGCTGTCACTGGGAGCCTGGGAGTTTCTCCATTAACATGACAGC 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-15 2e-43 gga-mir-15c 0.000002 -48.75 ..(((((((.............((((((..((.(((.((..(((((((((((((((((.(((((.....)))...)).)))))))))))))))))..)).))).))..))).)))...........))))))). (-48.75)