mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCATGTAAATATTGGAG CCAATATTGCTCGTGCTGCTGAA GAGGTTGTGTGTGTGTGCATGTGTTGTCTTGCTTTAGCAGCATGTAAATATTGGAGTTACTCCTTGGCCAATGCCTCCAATATTGCTCGTGCTGCTGAAGCAAGAAGTCACCAAGCAGCACATGCACGTCATCCTT 3 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-16 5e-38 fru-mir-16 0.00003 -66.9 ((((.(((((((((((((..(((...((((((((((((((((((..(((((((((..........(((....))))))))))))...))))))))))))))))))...)))...))).))))))))))....)))) (-66.90)