mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAGTGCTTACAGTGCAGGTA CTGCAGTGGAGGCACTTCTAG GGACTTTCTTGAGTGGACTTGGTTGGTGTCAATGTATTGTCAAAGTGCTTACAGTGCAGGTAGTATTATGGAATATCTACTGCAGTGGAGGCACTTCTAGCAATACACTTGACCATTTTAACCTTCCTCCAGGCATCC 4 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-17 2e-40 tni-mir-17-1 1e-16 -50.6 (((....((((.(.(((...((((((.(((((((((((((..((((((((.((.(((((.(((((((....)))).)))))))).)).))))))))...)))))))).)))))....)))))).))).)))))..))) (-50.60)