mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGATA CTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGC GGCTTTGTGCTAAGGTGCATCTAGTGCAGATAGTGAAGTAGACTAGCACCTACTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGCACGAGGGT 4 3 5' arm Danio_rerio mirbase 100 fru-mir-18 5e-33 -33.7 ..(((((((((((((.(((..(((.((((.(((((.((....))..)).))))))).)))..))).)))..)))))))))).. (-33.70)