mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAG ACTGCAGTGTGAGCACTTGAAGT TCTTAAATAAATCTCCTAATGTTGCAGTTGTGTTAGAGTTTCAGCAGTGCTAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAGTATTTCTGTCATCTACTGCAGTGTGAGCACTTGAAGTACTTCTAGCTTAATGCGTCTGGGATCCGAAGATTTCTGCTAGA 2 2 5' arm Danio_rerio mirbase mir-17 3e-18 xtr-mir-20a 3e-17 -48.6 (((.....((((((.(....(((.(((.((((((.(((((..((.((((((.(((((((((((.(((((.(((............)))))))).)))))))))))..)))))).))))))))))))).))).)))..).)))))).....))) (-48.60)