mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTTATCAGACTGGTGTTGGC GACAACAGTCTGTAGGCTGTC TTATGTGTCTTTATTGGCGTGGATATAAGTCTTTCCCAGTGTGTCAGATAGCTTATCAGACTGGTGTTGGCTGTTACATTCGCCCGGCGACAACAGTCTGTAGGCTGTCTGACATTTTGGGCATTTTCTTCTCCGATTAAAAATATGA 2 1 5' arm Danio_rerio mirbase mir-21 4e-20 fru-mir-21 5e-19 -56.8 ((((((......(((((.(.(((...((((....(((((.(((((((((((((((.(((((((.(((((.(((...........)))))))).)))))))))))))))))))))).))))).))))))).).))))).....)))))) (-56.80)