mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTTATCAGACTGGTGTTGGC CAACAGCAGTCTAATAGGCTGTC AGACAGACAGTAAAAGTGTCCCTTTCTGTCATGTAGCTTATCAGACTGGTGTTGGCTTTGAGTTTTTGGCAACAGCAGTCTAATAGGCTGTCTGACATTTTGGGCTTATTCGACGTACGGTTTGTTT 3 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-21 3e-33 dre-mir-21-1 0.000002 -48.5 ((((((((.(((..((((.(((....(((((..((((((((.((((((.(((((.(...........).))))).)))))).))))))))..)))))....)))..)))).....))).)))))))) (-48.50)