mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTGCCAGCTGAAGAACTGT AGTTCTTCACTGGCAAGCTTTA GCTGACCTGCAGCAGTTCTTCACTGGCAAGCTTTATGTCCTTGTGTACCAGCTAAAGCTGCCAGCTGAAGAACTGTTGTGGTTGGC 0 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-22 4e-28 fru-mir-22a 2e-32 -47.5 ((..(((.((((((((((((((((((((.((((((.((............)))))))))))))).)))))))))))))))))..)) (-47.50)