mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCACATTGCCAGGGATTTCCA GGAATTCCTGGCAGAGTGATTT CTCTTCTGCCGGCCAGGGGAATTCCTGGCAGAGTGATTTTTAAACCTAATGACTGAATCACATTGCCAGGGATTTCCAATGGCTCGTGTGACTCAGAG 2 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-23 4e-22 tni-mir-23a-3 9e-23 -43.16 (((((((((.(((((.(((((((((((((((.(((((((...............))))))).)))))))))))))))..))))).))).))...)))) (-43.16)