mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGCA CAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA TCTTTTCTAGCAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGATTGAACTCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCATCTGAGGAGAGGA 2 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-27 7e-39 xtr-mir-27b 9e-26 -49.7 ((((((((..(((((((((((((((((((....((((((((.((......)).))))))))..))))))))))))))))))).)))))))) (-49.70)