mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGTTAAGTTCTGC AGGACTTAACCCACTTGTGAACA GGTTGTGTGGTGTCAGGACTTAACCCACTTGTGAACAATGCATCGAACTTCAATGTTCACAGTGGTTAAGTTCTGCCGCCCCTAGACC 1 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-27 5e-40 fru-mir-27c 0.000000004 -38.8 ((((....((((.((((((((((((.(((.(((((((.((..........)).)))))))))))))))))))))).))))....)))) (-38.80)