mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTTCA CAGAGCTTGGCTGATTGGTGAACG TTCTGAGCGGGTGCAGAGCTTGGCTGATTGGTGAACGTGCATGGCTTGTGTTTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTTCACCCGAAAAGAA 3 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-27 1e-40 gga-mir-27b 0.0000003 -43.7 .(((...((((((.((((((((((((....(((((((.((((.....))))...)))))))..)))))))))))).))))))...))). (-43.70)