mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCAGTG CAGAGCTTAGCTAATCGGTGAGCA GTCATCACTCGCTCACGGCGCAGAGCTTAGCTAATCGGTGAGCATTGATCCCTTAAGAAAACTGTTCACAGTGGCTAAGTTCAGTGTCTGGAGTGAACGGGATGAC 3 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-27 4e-41 tni-mir-27e 0.000000001 -47.3 ((((((..((((((..(((((.(((((((((((....(((((((.(..((......))..).)))))))..))))))))))).)))))..))))))....)))))) (-47.30)