mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGT CTGAATTCAGATGGTGCCATAGA CTGCTCCTGGAAGCTGAATTCAGATGGTGCCATAGAGTATTTTATGGCATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCCTGGGCCG 2 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-29 2e-32 xtr-mir-29b 0.000000001 -37.2 ..((.((.(((((((((.((((((((((((..((((((........)).)))))))))))))))).))))).)))).)))).. (-37.20)