mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGT GCTGGTTTCACATGGTGGTTTAGA TCTTCCTCCAGATGCTGGTTTCACATGGTGGTTTAGATGTGTTCTACCAAAGTCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTTGGGGAGGG 2 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-29 2e-33 tni-mir-29b-1 1e-18 -38.1 .(((((((.((((((((((((((.((((((..((((((.((......))..)))))))))))).))))))))))).))).))))))). (-38.10)