mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAAACATCCCCGACTGGAAG TTCAGTTGGATGTTTGCTGT GTGCTGTATATGGGTATAACTGGTTGTTCATGCCTGTAAACATCCCCGACTGGAAGCTGTGCTACGCGGAAAACGAGCTTTCAGTTGGATGTTTGCTGTCATCGTCCAGTTCTGTCGCCTTGTATTAC 1 2 5' arm Danio_rerio mirbase mir-30 2e-28 xtr-mir-30d 0.000000006 -42.4 .....(((((.(((((.((((((.((...(((.(.((((((((((..(((((((((((((.((....))...)).))))))))))))))))))))).).))))).)))))).)).).)).)))))... (-42.40)