mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACAAGTGGGTTTGTTGACTG GTTGAAAAACCTAATGTTATT TCCATTAGAATAACAAGTGGGTTTGTTGACTGAAATAGTTGAAAAACCTAATGTTATTACTTATC GGGAAACCAAAGTACCCTAAGGCGCCGCACAAACATATTCACAAGAAGATGAGGAAAACACTCTTCGTCGCACCAACGTCAGTGCTTGTGTCACGTTTAAGTGTTTTCCATTTGCGTCCAGCCCCACCCATCTTCGAATTTAACACGATTTTTGGGTCCCGTGTGAAGATGAAGCGTGACCTTAATGCTATTACCCTTTTCAAGCACATGCATGTTAAGGGGATTGTTGGAATTGTTGAACCAGGTCTTGGTATTTTCAAGATCTTGGTCAGCTGTTCCTGCCACCTGGGTCATATGAAATTTGCCTTTTTTATGTGACAAAGGTCTCTGTCTTAATGGTGAAAATTGCATGGTTGTTCGATAAAACTGTTGTGATAATGTACAACACAATTATCGATAGCTTATGCAAAAATAATGTTTGTTTCTGAAATGGTTGGTAAGAAAATTTCTTTCCATATCATCACTTACAATTCCTTAATCCATTAGAATAACAAGTGGGTTTGTTGACTGAAATAGTTGAAAAACCTAATGTTATTACTTATCATTCTTAGATATTTTTTAATGGATGGGTATTGTTTAGTTATAATATCATAAGAATAATAAATAAGGTTATGAATCTCTTTAATAAGAGATATATGTTAAAAGTCACTCAATCAATATTCTTTATTAAATGTTTTGTGTAGAAATCTTATTTTGATTAAACAATTGCATTATTCAAAAGCAATTGCATTATTCAAGAAAATTAAAGATTATGCAAAGGTGGAAGACTTGAGAATGCACAAAAGATTTTTCAAGATCTTTTTCATGAAATGATAGCTTGGAAGA 2 1 5' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR4409 6e-29 -18.2 ........(((((((..(((((((.(((((((...))))))).))))))).)))))))....... (-18.2)