mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGATCTTGTG CAAGCTCGATTCTATGGGTCTC GCCACTTGTCATTAACCCGTAGATCCGATCTTGTGATAAGTTTGATGGCACAAGCTCGATTCTATGGGTCTCTGTCTCTGTGGT 4 0 5' arm Danio_rerio mirbase mir-10 4e-34 ppy-mir-99a 0.00000000007 -32.8 (((((..(.((...(((((((((..(((.((((((...(......)..)))))).)))..)))))))))...)).)...))))) (-32.80)