mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGATCTTGTG ACCCAAGCTCGATTCTGTGGGTCTC CACTTGTCACAAACCCGTAGATCCGATCTTGTGGCGTAATCGGCAACCCAAGCTCGATTCTGTGGGTCTCTGTCACTGTG 4 3 5' arm Danio_rerio mirbase mir-10 4e-34 dre-mir-99-1 0.0000002 -25.1 (((..((.(((.(((((((((..(((.((((((.((....)).))...)))).)))..)))))))))...))).)).))) (-25.10)