mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTATGATAACTGAAG TCAGTTATCATGGTACCGGTGCT GCTCCTCCGTCATGAATTGTCCATTTTCAGTTATCATGGTACCGGTGCTGTGTGCCTGTCAAGTACAGTACTATGATAACTGAAGATTGACGGTGCCAAACATCAGTGGAGT 1 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-101 1e-31 fru-mir-101b 3e-29 -45.3 (((((.(.(...((.((((((.((((((((((((((((((((..(((((.((.......))))))).)))))))))))))))))))).))))))..)).....).).))))) (-45.30)