mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTTT GGCTTCTCTACAGTGTTGCCTTG TCTGGCCACTCTGGGCTTCTCTACAGTGTTGCCTTGTAGCCTGGTGATCAAGCAGCATTGTACAGGGCTTTCAGCGTGTACAGAAC 3 2 3' arm Danio_rerio mirbase mir-103 1e-37 mdo-mir-107 3e-16 -33.8 ((((..(((.(((((((.((.(((((((((((.(((..((...))...)))))))))))))).))))))..))).)))..)))).. (-33.80)