mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTGTGGCATCATCAAGATGC TTTTGGTTCTTGCCAAGCCAA GAGAGTGCTTTGGTGTGGCATCATCAAGATGCAGACCCTGATTTTGGTTCTTGCCAAGCCAAAGAATTGT TGGAACCTGTGATGCAGTTGTATACAGAAGCAACTGATGGTTCTAATATTGAAGTTAAGGAGAGTGCTTTGGTGTGGCATCATCAAGATGCAGACCCTGATTTTGGTTCTTGCCAAGCCAAAGAATTGTTGGATCACTTGGAAAGTGTGCTTGCTAATGAACCAGCAGCTGTTACGAGAGGTCAGCATATTGTTGAAGTTAAGCCACCAGGAATAAGCAAGGGGTTGGTAGCTGAACAGGTTCTTATGACCATGGTTAATGGCGGCAATCCACCAGATTTTGTGCTGTGCATTGGAGATGATAGGTCCGATGAGGACATGTTTGAGAGCATTTTGAGGACAGTTTCGTGCCCATCATTACCATCAGCTCCAGAGATCTTTGCCTGCACTGTGGGTAGGAAGCCTAGCAAGGCCAAGTATTTTCTTGATGATGCTTCTGATGTTGTGAAGTTGCTTCAGGGCCTTGCTGCTTCATCCAATCCANAACCCAGGCATCTTGCTCATTCTCAAGTCTCTTTTGAGAGCACAGTT 4 1 5' arm Glycine_max mirnest 100 100 -24 ..((...(((((((.(((((..((((((((.(((...)))))))))))...))))).)))))))..)).. (-24)