mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA CGTGTTCACAGCGGACCTTGAT GGCTCTGTGGGATTTCAGACTCTGGCTTTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCTTACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGAGCCTTTTAACATCAGCAGGCC 5 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-124 6e-31 mdo-mir-124a-2 3e-35 -43.4 (((.((((..(((...((.(((((.((((..((((((((.(((..(((((((((((....))).))))))))..))).))))))))..))))))))).))......))).))))))) (-43.40)