mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA TGTGTTCACAGTGGACCTTGAT GGTTTTTGCTCTTTGTGTTCACAGTGGACCTTGATTTAATTTCAATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGAGAAGCC 4 0 3' arm Danio_rerio mirbase mir-124 2e-36 fru-mir-124-3 9e-38 -33.7 (((((((.(((((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).)))))))).)))))))))))) (-33.70)